Редактирование генома тихоходок: первый шаг к созданию «живых капсул времени»?

Пост опубликован в блогах iXBT.com, его автор не имеет отношения к редакции iXBT.com
| Рассуждения | Флора и фауна

Тихоходки — создания удивительные. Эти микроскопические беспозвоночные, которых за внешность и неторопливость прозвали «водяными медведями», способны выживать в самых экстремальных условиях: от ледяного холода космоса до кипящих геотермальных источников. Их устойчивость к обезвоживанию, радиации и экстремальным температурам поражает воображение и уже давно привлекает внимание ученых.

Секрет живучести тихоходок — в их невероятных механизмах клеточной защиты и регенерации. Однако до недавнего времени эти механизмы оставались тайной за семью печатями. Традиционные генетические методы оказывались бессильны перед этими «микроскопическими танками». Ученым удавалось лишь временно «отключать» работу генов тихоходок, но создать устойчивые линии с измененным геномом оставалось недостижимой мечтой.

Прорыв совершили японские ученые из Токийского университета. Вдохновившись методом DIPA-CRISPR, успешно применяемым для редактирования генома насекомых, они адаптировали его для работы с тихоходками. Суть метода заключается во введении комплекса Cas9-РНК, который работает как «молекулярные ножницы», в организм взрослой особи. Комплекс, попадая в яйцеклетки, вносит изменения в ДНК потомства.

Тихоходка, иллюстрация
Автор: Designer

Ученые столкнулись с рядом сложностей. Во-первых, необходимо было точно определить стадию развития тихоходки, на которой введение Cas9-РНК будет наиболее эффективным. Во-вторых, требовалось подобрать оптимальную концентрацию компонентов, чтобы не навредить хрупкому организму.

Репрезентативные фотографии яиц R. varieornatus (A) и особей в возрасте 8 (B) и 10 дней (C). (D) Стадия родительских самок для инъекции важна для успешного редактирования генов в DIPA-CRISPR. Чтобы получить родительских самок в определенном возрасте, яйца собирали и ежедневно наблюдали за их вылуплением. Только что вылупившихся молодых особей (в возрасте 0 дней) отделяли и выращивали в течение определенного периода времени до инъекции. После инъекции Cas9 RNPs инъецированные тардиграды выращивались в течение 10 дней, а отложенные яйца (потомство G0) собирались и выращивались. Выросшие особи G0 были отдельно подвергнуты экстракции геномной ДНК и ПЦР. ПЦР-ампликоны непосредственно анализировали методом секвенирования по Сэнгеру. Генетически отредактированное потомство G0 было получено от родителей, которым инъекции были сделаны в возрасте от 7 до 10 дней.
Автор: Single-step generation of homozygous knockout/knock-in individuals in an extremotolerant parthenogenetic tardigrade using DIPA-CRISPR Kondo K, Tanaka A, Kunieda T (2024) Single-step generation of homozygous knockout/knock-in individuals in an extremotolerant parthenogenetic tardigrade using DIPA-CRISPR. PLOS Genetics 20(6): e1011298. https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1011298 CC-BY 4.0 Источник: journals.plos.org

В качестве подопытных выступили тихоходки вида Ramazzottius varieornatus — признанные чемпионы по выживаемости. В результате серии экспериментов японским генетикам удалось подобрать оптимальные условия и получить первое в мире поколение тихоходок с измененным геномом.

Открытие имеет колоссальное значение. Теперь у ученых появился инструмент для глубокого изучения механизмов экстремальной устойчивости тихоходок. Понимание этих механизмов может привести к созданию новых технологий сохранения биологических материалов, таких как вакцины и лекарства, а также к разработке методов защиты человека от радиации и других неблагоприятных факторов.

(A) Схематическое изображение структуры гена RvY_01244 (ABCG), а также расположение трех кРНК (коричневые стрелки) и геномных ПЦР-праймеров (синие стрелки). Зеленые рамки представляют экзоны, а серые линии — интроны или межгенные области. (B) Репрезентативное изображение агарозного геля геномных ПЦР-ампликонов, полученных из некоторых потомков G0. В этом геле четыре образца слева демонстрируют ампликоны с размером, ожидаемым от немодифицированного генома (WT), в то время как правый образец, обозначенный как m1, демонстрирует единственную полосу, представляющую более короткий размер (Δa), чем WT, что примерно соответствует размеру с делецией фрагмента a (crRNA1-crRNA2). Примечание: ампликон с размером WT не был обнаружен в образце m1. (C-F) Характер редактирования генов у четырех полученных особей G0: комплексное редактирование (m1, C), 1-нт вставка (m2, D), 3-нт делеция (m3, E) и две 1-нт вставки (m4, F). (C) Красная изогнутая линия представляет делецию промежуточной области между crRNA1 и crRNA2. Оранжевая рамка представляет промежуточный фрагмент ДНК между крРНК2 и крРНК3, который был вставлен в обратной ориентации. (D-F) Схематическое изображение места редактирования гена и электроферограммы при прямом секвенировании по Сэнгеру геномных ПЦР-ампликонов с эталонной последовательностью (REF).
Автор: Single-step generation of homozygous knockout/knock-in individuals in an extremotolerant parthenogenetic tardigrade using DIPA-CRISPR Kondo K, Tanaka A, Kunieda T (2024) Single-step generation of homozygous knockout/knock-in individuals in an extremotolerant parthenogenetic tardigrade using DIPA-CRISPR. PLOS Genetics 20(6): e1011298. https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1011298 CC-BY 4.0 Источник: journals.plos.org

Более того, тихоходки — близкие родственники таких популярных модельных организмов, как мушка дрозофила и нематода C. elegans. Разработанный метод редактирования генома позволит использовать тихоходок для сравнительных эволюционных исследований, открывая новые горизонты в биологии развития.

Это открытие — еще одно доказательство, что самые маленькие и незаметные создания на нашей планете могут таить в себе огромные секреты, способные изменить мир.

Если тихоходки такие живучие, зачем вообще нужно редактировать их геном? Неужели недостаточно просто изучать их природные способности?

Это резонный вопрос. Действительно, тихоходки — уникальный объект для изучения экстремофилии. Однако, чтобы понять, как именно работают их защитные механизмы на молекулярном уровне, наблюдений недостаточно.

Редактирование генома — это как скальпель в руках хирурга. «Выключая» отдельные гены и наблюдая за последствиями, ученые смогут точно определить, какие гены отвечают за устойчивость к обезвоживанию, радиации или экстремальным температурам.

В статье говорится, что большинство мутаций у тихоходок оказываются гомозиготными, то есть затрагивают обе копии гена. Но ведь тихоходки размножаются партеногенезом — без участия самцов. Как это возможно?

Это один из самых интригующих вопросов, на которые еще предстоит найти ответ. Ученые предполагают, что в процессе мейоза (деления клеток), который происходит и при партеногенезе, у тихоходок происходит некий «фокус», который приводит к дупликации отредактированного гена. Возможно, это связано с особенностями строения и функционирования их хромосом.

Ученые «отключили» у тихоходок ген, отвечающий за синтез трегалозы — вещества, которое помогает многим организмам переживать обезвоживание. Однако оказалось, что это не повлияло на выживаемость взрослых особей, но привело к гибели эмбрионов. Означает ли это, что трегалоза не играет роли в устойчивости самих тихоходок?

Не совсем. Скорее всего, взрослые тихоходки накапливают достаточно трегалозы в своем организме, чтобы обеспечить собственную выживаемость. А вот эмбрионам трегалоза, по-видимому, жизненно необходима на ранних этапах развития. Это открытие еще раз подчеркивает сложность и многогранность механизмов адаптации тихоходок к экстремальным условиям.

36 комментариев

108295282012109436047@google
Даже тихоходки не выживут а среде тёмной материи, она немедленно убивает всё живое, её температура минус 449,5 °С.
101088209368274208995@google
Опять побасенки завезли) Темная материя пробралась в Вашу черепную коробку?)
108295282012109436047@google
101088209368274208995@google
Да-Да, наш окадемик даже не в курсе, что такое температура, раз пишет такие цифры)
108183418619197394521@google
тсссс....
не вспугните. это-же бесплатный цирк
101088209368274208995@google
Вот Геша никак не успокоится и постит разное мракобесие под каждой статьей. Почему он не может оставить в покое?)
Вы узнайте, что такое температура, может и поймете, почему это побасенки. Но у Вас со школьным курсом физики те же ведь проблемы)
101088209368274208995@google
Мало без него в интернете рупоров мракобесия?)
А почему тогда я должен перестать выводить фриков на чистую воду?) Или только у вас с Гешей есть право высказываться?)
101088209368274208995@google
Что такое температура, Юля?)
101088209368274208995@google
Температура — средняя кинетическая энергия системы, состоящей из обычной материи. Темная материя не взаимодействует с обычной, о какой температуре вообще может идти речь?) Я уж молчу, что минимальная возможная температура -273 С, а Геша пишет про -459)
Вот поэтому это побасенки, о чем я сразу и написал)
П.С. Тихоходки никак не ощутят темную материю и если успеют перестроить свой организм, то выживут.
П.П.С. В статье много бреда написано про тихоходок, если что. Не мешало бы автору глянуть https://youtu.be/7K88BapadVs?si=jdxPzQjQqHRo6IE2
101088209368274208995@google
И я буду дальше. Не мешайте мне бороться с мракобесием в меру своих скромных способностей)
101088209368274208995@google
А Вы не суйтесь, если по делу Вам написать нечего)
101088209368274208995@google
«Оставьте Евгения в покое!!!»
С себя начните)
Суйтесь, потешайте публику)
101088209368274208995@google
В большинстве своем публика адекватная, а потому на сцене Геша и Юля)
108295282012109436047@google
Основная ошибка англосакской теоретической науки состоит в том, что они решили и постановили из своих бошек, что вещество это и есть барионная материя.
На самом же деле вещество состоит из двух материй: тёмной и светлой. Таким образом, сама тихоходка, а так же и Ципцюра, в конечном счёте состоят их двух материй, одна из которых тёмная.
Температура 273,15 °С это наименьшая температура вещества, где тёмная материя уже купирована светлой. Поэтому температура тёмной материи в свободном состоянии должна быть ниже 273,15 °С и составляет 449,5 °С.
Ю

Температура 273,15 °С это наименьшая температура вещества, где тёмная материя уже купирована светлой. Поэтому температура тёмной материи в свободном состоянии должна быть ниже 273,15 °С и составляет 449,5 °С.

Я правильно понимаю, купирована — это, значит, перекрыта? Тогда всё логично, и температура должна повышаться. Оттуда и разница между 273,15 °С и 449,5 °С.
108295282012109436047@google
Конечно, это правильно. Из-за низкой температуры тёмной материи в свободном состоянии она не совместима с любой жизнью.
Но если она купирована светлой материей, то минимальная температура вещества повышается что и делает возможным расцвета жизни во вселенных.
Ю
Конечно, это правильно. Из-за низкой температуры тёмной материи в свободном состоянии она не совместима с любой жизнью.
Но если она купирована светлой материей, то минимальная температура вещества повышается что и делает возможным расцвета жизни во вселенных.

Спасибо за ответ. Как это всё интересно. В нашей Вселенной всё взаимосвязано. Это огромная система, в которой всё упорядочено.
108295282012109436047@google
Конечно, это правильно. Из-за низкой температуры тёмной материи в свободном состоянии она не совместима с любой жизнью.
Но если она купирована светлой материей, то минимальная температура вещества повышается что и делает возможным расцвета жизни во вселенных.
Спасибо за ответ. Как это всё интересно. В нашей Вселенной всё взаимосвязано. Это огромная система, в которой всё упорядочено.

Да, во вселенных управляющим законом является не Закон всемирного тяготения Великого Ньютона, а Закон всемирного равновесия обычных Пономаренко и Тихомирова.
Ю

Да, во вселенных управляющим законом является не Закон всемирного тяготения Великого Ньютона, а Закон всемирного равновесия обычных Пономаренко и Тихомирова.

И в это равновесие лучше не вмешиваться.
108295282012109436047@google
Прежде всего об этом равновесии надо знать. А раз мы об этом будем знать, то постепенно будем знать и о последствиях нашего вмешательства. Поэтому в этом веке надо отказаться от безумной идее англосакса Илона Маска о колонизации Марса и Луны.
Ю
Прежде всего об этом равновесии надо знать. А раз мы об этом будем знать, то постепенно будем знать и о последствиях нашего вмешательства. Поэтому в этом веке надо отказаться от безумной идее англосакса Илона Маска о колонизации Марса и Луны.

Может Маск ещё передумает? Очень на это надеюсь.
108295282012109436047@google

Может Маск ещё передумает? Очень на это надеюсь.

Я просил Роугароу информировать Маска, но он говорит, что всё под контролем, Маск знает обо всём.
И якобы, запланирована авария, но не с людьми, а с роботами на ИИ.
В общем, все врут, и кто больше и кто меньше — неизвестно.
Ю

В общем, все врут, и кто больше и кто меньше — неизвестно.

А вот это точно. Всё больше складывается ощущение, что нам вешают лапшу на уши.
Ю
Основная ошибка англосакской теоретической науки состоит в том, что они решили и постановили из своих бошек, что вещество это и есть барионная материя.
На самом же деле вещество состоит из двух материй: тёмной и светлой. Таким образом, сама тихоходка, а так же и Ципцюра, в конечном счёте состоят их двух материй, одна из которых тёмная.
Температура 273,15 °С это наименьшая температура вещества, где тёмная материя уже купирована светлой. Поэтому температура тёмной материи в свободном состоянии должна быть ниже 273,15 °С и составляет 449,5 °С.

Евгений, а что такое антинейтрино? Я так поняла, что его не существует в природе. Или как?
108295282012109436047@google
Нейтрино, это мельчайший сгусточек тёмной материи, защищённый от рассеивания информационным полем. Однако во вселенных всё пространство загружено фотонным континиумом. Фотоны имеют очень высокое сродство к тёмной материи, поэтому изолирующей способности информационного поля недостаточно и фотоны прорываются к нейтрино. Но из-за низкой температуры тёмной материи фотоны скукоживаются до невузбуждённого размера и не успевают соединиться в энергетическое кольцо. Однако, на краткий промежуток времени нейтрино из свободного сгустка тёмной материи становится веществом (сообществом тёмной и светлой материй) и, поскольку фотонов прорывается к нейтрино крайне мало, получившаяся микро частица вещества приобретает мизерный отрицательный заряд. Информационное поле имеет свойство выталкивать из себя фотоны и вещество. Поэтому оно выталкивает светлую материю, которая просочилась к нейтрино, в это время нейтрино теряет свой мизерный электрический заряд и становится нейтральной элементарной частицей. Потом всё повторяется, и нейтрино как бы осциллирует по заряду. Поэтому мы предлагаем термин «антинейтрино» не вводить, так как нейтрино, когда приобретает мизерный электрический заряд, перестаёт быть этим самым пресловутом нейтрино и становится веществом (сообществом светлой и тёмной материи).
Ю
Нейтрино, это мельчайший сгусточек тёмной материи, защищённый от рассеивания информационным полем. Однако во вселенных всё пространство загружено фотонным континиумом. Фотоны имеют очень высокое сродство к тёмной материи, поэтому изолирующей способности информационного поля недостаточно и фотоны прорываются к нейтрино. Но из-за низкой температуры тёмной материи фотоны скукоживаются до невузбуждённого размера и не успевают соединиться в энергетическое кольцо. Однако, на краткий промежуток времени нейтрино из свободного сгустка тёмной материи становится веществом (сообществом тёмной и светлой материй) и, поскольку фотонов прорывается к нейтрино крайне мало, получившаяся микро частица вещества приобретает мизерный отрицательный заряд. Информационное поле имеет свойство выталкивать из себя фотоны и вещество. Поэтому оно выталкивает светлую материю, которая просочилась к нейтрино, в это время нейтрино теряет свой мизерный электрический заряд и становится нейтральной элементарной частицей. Потом всё повторяется, и нейтрино как бы осциллирует по заряду. Поэтому мы предлагаем термин «антинейтрино» не вводить, так как нейтрино, когда приобретает мизерный электрический заряд, перестаёт быть этим самым пресловутом нейтрино и становится веществом (сообществом светлой и тёмной материи).

Большое спасибо за ответ. Очень долго мучил вопрос, что же такое антинейтрино. Теперь поняла. Определение «Фотон» и «Нейтрино» я запомнила легко.
108295282012109436047@google
Более подробно о температуре минус 449,5 °С смотрите в наших научных статьях.
http://www.naupri.ru/journal/749
http://www.naupri.ru/journal/3805
http://www.naupri.ru/journal/3850
http://www.naupri.ru/journal/3884
http://www.naupri.ru/journal/3893
http://www.naupri.ru/journal/3907

Добавить комментарий

Сейчас на главной

Новости

Публикации

А вы знали: Как правильно хранить подсолнечное масло?

Недавно в компании хозяек зашел разговор о том, как правильно хранить растительное масло. Этот вопрос, казалось бы, прост, но вызвал множество споров и сомнений. Одни утверждали, что масло...

Как молнии генерируют электромагнитные волны, достигающие космоса?

Мы привыкли воспринимать молнии как зрелищное, но, по сути, локальное явление, грозную силу природы, разыгрывающую свой спектакль в пределах земной атмосферы. Однако последние исследования...

Мал, да удал. Обзор портативного твердотельного накопителя Fanxiang PS2000W (до 20 ГБ/с)

Когда обычной флешки уже мало, на помощь приходит компактный портативный твердотельный накопитель. Обновленная модель твердотельного накопителя Fanxiang PS2000W обеспечивает высокую скорость обмена...

Сколько на самом деле белка в яйце и от чего зависит его количество

Яйца являются одним из самых популярных и доступных источников белка в рационе человека. Однако, несмотря на их повсеместное употребление, не все знают, сколько белка на самом деле содержится в...

Может ли запутанность фотонов объяснить сознание? Роль миелина как квантового резонатора

Сознание — сложнейший феномен, который до сих пор остается загадкой для науки. Мы знаем, что оно основано на синхронной активности миллионов нейронов, но как именно эта синхронизация...

Откуда прилетел астероид, уничтоживший динозавров? Ученые проследили его путь до области за Юпитером

66 миллионов лет назад мир, каким мы его знаем, был совершенно иным. По Земле бродили гигантские динозавры, господствовавшие на планете на протяжении миллионов лет. Однако их царствование...