4,2 миллиарда лет назад: встречайте LUCA, прародителя всего живого

Пост опубликован в блогах iXBT.com, его автор не имеет отношения к редакции iXBT.com
| Рассуждения | Наука и космос

Попытки заглянуть в колыбель земной жизни, разгадать тайну зарождения первого организма, из которого проросло все многообразие живых существ — задача, не дающая покоя ученым уже не одно десятилетие. В центре этого квеста — LUCA, последний универсальный общий предок, тот самый, чьи гены хранят в себе и бактерии, и гигантские синие киты, и мы с вами.

Долгое время наши представления о LUCA напоминали размытые очертания на старинной фотографии. Ученые предполагали, что это был примитивный организм, едва ли способный на нечто большее, чем элементарное самокопирование. Однако недавнее исследование, проведенное международной группой ученых, перевернуло привычные представления о нашем далеком предке.

Используя сложные математические модели и учитывая множество факторов, влияющих на эволюцию генов, ученые смогли реконструировать предполагаемый геном LUCA. Результаты оказались ошеломляющими: вместо примитивного набора генов, LUCA обладал удивительно сложной для своего времени генетической архитектурой. 2600 генов, кодирующих белки — таков был арсенал этого микроскопического организма, в чьем геноме уже тогда были заложены основы для всего будущего биологического разнообразия.

LUCA, вольная интерпретация
Автор: ИИ Copilot Designer//DALL·E 3 Источник: www.bing.com

Но и это еще не все. Анализ генома позволил предположить, что LUCA существовал гораздо раньше, чем считалось до сих пор — около 4,2 миллиарда лет назад. Это время — всего несколько мгновений по геологическим меркам после формирования самой планеты — эпоха бурных геологических процессов и беспощадной метеоритной бомбардировки. То, что жизнь могла не просто зародиться, а достичь такого уровня сложности в столь неблагоприятных условиях, заставляет по-новому взглянуть на феномен жизни и ее удивительную способность к адаптации.

Результаты исследования показывают, что LUCA жил около 4,2 млрд лет с 95% доверительным интервалом, охватывающим 4,09-4,33 млрд лет в модели ILN (оранжевый) и 4,18-4,33 млрд лет в модели GBM (бирюзовый). При перекрестном подходе узлы, соответствующие одним и тем же видовым дивергенциям (т. е. зеркальные узлы), имеют одинаковую апостериорную временную плотность. На этом рисунке показаны соответствующие апостериорные временные плотности зеркальных узлов для последних универсальных, архейных, бактериальных и эукариотических общих предков (LUCA, LACA, LBCA и LECA, соответственно); последний общий предок митохондриальной линии (Mito-LECA); и последний пластидный общий предок (LPCA). Фиолетовые звезды обозначают узлы, откалиброванные по окаменелостям. Arc, Архея; Bac, бактерии; Euk, Эукария.
Автор: Moody, E.R.R., Álvarez-Carretero, S., Mahendrarajah, T.A. et al. The nature of the last universal common ancestor and its impact on the early Earth system. Nat Ecol Evol (2024). https://doi.org/10.1038/s41559-024-02461-1 CC-BY 4.0 Источник: www.nature.com

Исследователи предполагают, что колыбелью LUCA стал древний океан, омывавший молодую Землю. Об этом свидетельствуют, в частности, гены, отвечающие за защиту от губительного ультрафиолетового излучения. Анализ генома также указывает на то, что LUCA, вероятно, использовал водород как основной источник энергии.

Важно отметить, что LUCA, скорее всего, не был одиноким странником в безбрежном океане ранней Земли. Ученые полагают, что он был частью целой экосистемы примитивных организмов, большинство из которых, к сожалению, не оставили после себя прямых потомков.

a, Представление LUCA, основанное на реконструкции содержимого генов наших предков. Было сделано предположение, что названия генов, выделенные черным цветом, присутствуют в LUCA ниже самого строгого порога (PP = 0,75, выборка в обоих доменах); те, которые выделены серым цветом, присутствуют при наименее строгом пороге (PP = 0,50, без требования присутствия в обоих доменах). b, LUCA в контексте древа жизни. Ветви на древе жизни, которые сегодня оставили потомков, окрашены в черный цвет, а те, которые не оставили потомков, окрашены в серый цвет. Как общий предок существующей клеточной жизни, LUCA является старейшим узлом, который может быть реконструирован с помощью филогенетических методов. Она должна была разделить раннюю Землю с другими линиями (выделенными бирюзовым цветом), которые не оставили потомков среди образцов клеточной жизни сегодня. Тем не менее, эти линии, возможно, оставили след в современных организмах, перенеся гены в отобранное древо жизни (красные линии) до их исчезновения. c, хемоавтотрофный метаболизм LUCA, вероятно, зависел от газообмена с ближайшим окружением для получения органического углерода (CОрг) через ацетогенез, а также, возможно, запустил метаболизм в обратном направлении. d, LUCA в контексте ранней экосистемы. Командир2 и H2 который подпитывал вероятно ацетогенный метаболизм LUCA, мог происходить как из геохимических, так и из биотических факторов. Органическое вещество и ацетат, произведенные LUCA, могли создать нишу для других метаболизмов, в том числе тех, которые перерабатывают CO2 и H2 (как в современных отложениях). e, LUCA в контексте системы Земля. Ацетогенный LUCA мог быть ключевой частью как поверхностных, так и глубоких (хемо)автотрофных экосистем, питаемых H2. Если бы метаногены также присутствовали, водород выделялся бы в виде CH4 в атмосферу, в пересчете на H2 фотохимией и, таким образом, возвращается на поверхность экосистемы, повышая ее продуктивность. Ferm., ферментация
Автор: Moody, E.R.R., Álvarez-Carretero, S., Mahendrarajah, T.A. et al. The nature of the last universal common ancestor and its impact on the early Earth system. Nat Ecol Evol (2024). https://doi.org/10.1038/s41559-024-02461-1 CC-BY 4.0 Источник: www.nature.com

Разумеется, реконструкция событий такой давности — дело непростое, и авторы исследования не исключают возможности ошибок. Однако, даже если какие-то детали окажутся неточными, это не умаляет значимости проделанной работы.

Исследование LUCA — это не просто поиск корней на древе жизни. Это попытка понять саму суть жизни, ее невероятную способность к выживанию и трансформации. И по мере того, как мы будем проникать все глубже в тайны прошлого, мы будем все ближе к пониманию того, как на нашей планете зародилось величайшее из чудес — чудо жизни.

44 комментария

P
Эта статья наглядно показывает насколько далеко может заходить вранье дипломированных бездельников.
R
Ага, то ли дело честнейшие продавцы циркониевых браслетов, заряженной структурированной воды, и карманных стиральных машин с пачку сигарет.
R
Или попы. Там вообще с зарождением жизни все просто
Eldarado
И золотых пирамидок Ю-Си-Кай )))
NoName.Man
Да не говори. Это ж надо так завраться — «при перекрестном подходе узлы, соответствующие одним и тем же видовым дивергенциям, имеют одинаковую апостериорную временную плотность.» Разную они имеют, разную! Дураку же понятно. А то обложатся своими дипломами и думают, что умнее всех
101088209368274208995@google
Так Вы не мучайтесь, просто проходите мимо)
Y
Luca — уменьшительно-ласкательное от Lucifer? :)
NoName.Man
Last universal common ancestor
395996351575@odnoklassniki
Конечно же, нет! Это Люся из бессоновской документалки про мозговое развитие! ;⁠) :⁠-⁠P
s
Нет, это от Луки ( возможно Мудищева).
A
Пару лет назад говорили о 366 генах у luca. Опять грантоеды хотят «скандалы, интриги, расследования».
NoName.Man
Нет, чтобы лопату в руки взять и делом заняться, как ты. Да?
A
«Возможно запустили», «вероятно зависел», «мог быть» — это все предположения, на основе которых делают свои подсчеты одни. У другой группы свои «может быть». И соревнование не в том, что нашли, а чтобы в их «быть может» побольше генов натолкать, сделать подревнее.
В палеонтологии очень часто встречаются древности, которые затем сильно молодели. А тут вообще просто занимаются комбинаторикой и кластерным анализом, которые очень сильно зависят от начальных данных и критериев кластеризации.
P.S. Пройдет еще пару лет — и найдутся организмы «старше Земли» с воплями «надо пересмотреть возникновение Земли и всей космологии».
S
Пройдет еще пару лет — и найдутся организмы «старше Земли» с воплями «надо пересмотреть возникновение Земли и всей космологии».

Может и так. И что? Отсутствие догматов, которые нужно отстаивать с пеной у рта, не зависимо ни от каких открывшихся новых фактов, — это одно из отличий научной теории от религиозной.
A
Вопрос в том, что теории могут быть сколь угодно дикими и странными. В данном конкретном случае все упирается в математическое моделирование, начальные условия которого зависят от многих неопределенных параметров и задаются исследователем по своему желанию поскольку имеется слишком мало данных из раскопок. Подсчитайте, сколько может быть и если указано в подписи к рисунку.
Кроме того, повторюсь, палеонтологами было обнаружено множество «великих предков», которые при более тщательном анализе таковыми не являлись — находились или более ранние претенденты на роль «великих предков», или при накоплении находок такая роль отвергалась. Но это — анализ реальных окаменелостей, а не просто математическое моделирование, которому сейчас слишком доверяют.
S
Вы хотите сказать, что эта теория очень не надежна? Так с вами, скорее всего, даже авторы согласятся на все сто. В современной физике (особенно астрофизике) полно таких теорий. Это норма для научного сообщества.
Вопрос в том, что теории могут быть сколь угодно дикими и странными

Да это не вопрос, конечно могут. Даже те, которые имеют реальное подтверждение на практике, могут по прежнему казаться невероятными. Про двухщелевой эксперимент слышали? Реально же крышу сносит! Но это не просто теория, а реально наблюдаемое явление (https://www.youtube.com/watch?v=WhSLqh8LxUI)
A
Про двухщелевой эксперимент слышали? Реально же крышу сносит! Но это не просто теория, а реально наблюдаемое явление (https://www.youtube.com/watch?v=WhSLqh8LxUI)

Многословный и экзальтированный рассказ об опытах Дэвиссона-Джермера 1920-х годов и Фабриканта 1947 года… Ничего такого, чтобы так нудно и одновременно «волнительно» об этом говорить.
a
Вас кто то обидел? Вам так жизненно необходимо самоутвердиться за счёт людей умнее вас, пытаясь их принизить омерзительно убогими средствами в глазах наиболее быдлядских комментаторов, кому ваши «старания» покажутся «убедительными»? Позоритесь аки свинья.
101088209368274208995@google
Ну так актинобактерии есть, у которых около 800 генов, кодирующих белки. А сейчас по гипотезе рационализации эксперименты подъехали, так что набор мог быть и больше, просто потом укоротился у отдельных видов.
395996351575@odnoklassniki
Эта «новость» выдаётся за новость уже лет пятнадцать. И на следующий год будет очередной релиз от нервосети-новостегенератора на тему «Кто твои предки? Знай и помни!»…
a
Не позорьтесь, уважаемый. Ну не позорьтесь!
S
4,2 миллиарда лет назад. Это время — всего несколько мгновений по геологическим меркам

Чего? Предполагаемый возраст всей вселенной — 13 млрд. лет, какие несколько мгновений?
101088209368274208995@google
Корень «гео» в слове геологический Вас не смущает?)
S
Нет, не смущает. А должен? Можете пояснить, каким образом этот корень так меняет масштаб времени, что более трети возраста самой вселенной становится мгновением? Тем более, что сама наша планета зародилась менее 5 млрд. лет назад.
101088209368274208995@google
Мдя. «В переводе с греческого „гео“ означает земля. Именно поэтому науки изучающие землю имеют в своих названиях эту приставку гео. География, геология и даже геометрия имеют отношение к земле.» По геологическим меркам — это как раз по меркам существования Земли. При чем тут 13 млрд. и вселенная?
А если дальше прочитать «Это время — всего несколько мгновений по геологическим меркам после формирования самой планеты». Смысл в том, что жизнь появилась практически сразу после формирования Земли, как Катрхей закончился и собственно геология начинается.
S
При том, что вселенная старше Земли. И если уж по меркам вселенной это очень большой срок, то по меркам Земли — тем более.
Кстати… зарождение самых простых форм жизни же, как считается, произошло не ранее 4 млрд. назад. Или уже не так? 4.2 млрд. лет назад же Земля была не просто «безвидна и пуста», а вообще вся состояла из действующих вулканов и постоянно «пополняемых» кратеров. Не? Я, наверное, отстал от жизни. И «Википедия» тоже.
101088209368274208995@google
У Вас сложности с семантическим восприятием текста?) Несколько сотен миллионов в течении которых и появлась жизнь в Архее — это и есть мгновение даже в рамках истории Земли, не говоря уже о времени существоввания вселенной. Или с мтематикой у Вас сложности… Не пойму.
Поясню, как считать отношение части к целому. 200 млн. разделите на 4,8 млрд. Получится не сильно большое число. А уж если разделить на 13 млрд., то еще меньше.
S
В приведенной цитате ничего нет про продолжительность зарождения этой формы жизни или ее существования, там есть только сама «дата» зарождения — 4.2 млрд. лет назад. И 4.2 млрд. — не мгновение.
101088209368274208995@google
Напрямую написано: «Это время — всего несколько мгновений по геологическим меркам после формирования самой планеты ». Значит все же проблемы с семантическим восприятием текста…
Eldarado
даже по геологическим это не несколько мгновений, это бОльшая часть истории Земли как планеты
101088209368274208995@google
200 млн. — это бо`льшая часть из 4,5 млрд.?) Очередной математический гений?)
Eldarado
Вам русский язык не родной? Оригинальная цитата: «4,2 миллиарда лет назад. Это время — всего несколько мгновений по геологическим меркам», — означает, что оценивается именно 4,2 миллиарда, а не 300 миллионов из предполагаемого возраста Земли в 4,5 миллиарда лет.
P.S. кто бы говорил про математику )))
101088209368274208995@google
«Это время — всего несколько мгновений по геологическим меркам после формирования самой планеты»
Не пробовали читать предложения целиком?) После формирования планеты, то есть интервал времени от формирования планеты (она сформирована) до появления жизни.
Я и буду говорить про математику и семантическое восприятие текста) Вы и читать не умеете)
П.С. Для малограмотных объясню, откуда 200 млн. Самая ранняя обнаруженная порода датируется 4,4 млрд. лет назад. Собственно от нее и начинается геология. ЛУКА — дали оценку 4.2 млрд лет назад. В чем сложность посчитать (4,4-4,2)/4,4? Или Вы 4,2 на 4,5 делили?) На основании чего?)
K
Несколько мгновений после формирования планеты. А что до времени и возраста вселенной, то там у учёных гораздо больше несходняков, чем у этого гипотетического организма.
Z
Речь про возраст Земли, 4.5 миллиарда лет
J
В статье оговорка, что LUCA вероятно получал гены от других микроорганизмов. Такое бывает в природе. Называется горизонтальный перенос генов. Особенно характерно для самых примитивных организмов, не имеющих ядерной оболочки, каким без сомнения и был LUCA.
Но раз так, то геном LUCA должен был сформироваться не 4.2 миллиарда лет назад, а значительно позже. Я б вычел из его возраста 0.5-1 млрд. лет. Тогда момент его возникновения выглядит более реалистично.
112688026207459145584@google
Luca это сперма Бога
i
хорошо, если не сопля
11369307@vkontakte
О, Ктулху фхтагн!
114776015532226571355@google
Хoxлы уже тогда были, как раз в то время лопатой черное море копали))))
118070135625949507794@google
Та самая червивая херобора из «Атаки Титанов»
U
Вон там есть какой-то алкОгль, значит всё нормально, оно бухало. Верим ))
S
«LUCA, последний универсальный общий предок, тот самый, чьи гены хранят в себе и бактерии, и гигантские синие киты, и мы с вами». Получается что у Адама, Евы и меня есть общий предок? Как забавно. Или Господь Бог всех сотворил одновременно в один из 6-ти дней (если Библия не врет)?
M
Что то как то мало вони от иконоцеловальников...)

Добавить комментарий

Сейчас на главной

Новости

Публикации

Как образуются облака? Ученые отправляются на гору Хельмос, чтобы найти ответ

Облака — привычная часть нашего неба, неотъемлемый элемент пейзажа и важнейший компонент климатической системы Земли. Но несмотря на их повсеместность, многие аспекты образования и...

С суши обратно в воду: эволюция хищных динозавров, которые «решили» сменить среду обитания

Известно, что жизнь на Земле зародилась и развивалась в океане. Сначала рыбы, а затем и древние позвоночные на протяжении миллионов лет постепенно меняли среду обитания, выходили из воды на сушу и...

Стоит ли покупать фотоаппарат Canon EOS R50? Первые впечатления после Sony ZV-E10 и отличия от Canon EOS R10

Примерно месяц назад я избавился от Sony ZV-E10, а взамен обзавелся Canon R50. Мнений много не бывает — а потому возможно кому-то будет полезно узнать, к каким соображениям я пришел...

Пушка для лосося: для чего создавалась и как работает

Пушка для лосося, также известная как «рыбный туннель» от компании Woosh Innovations, представляет собой уникальное устройство для перемещения рыб через препятствия в реках и водоемах. Этот проект...

Обзор пассатижей Deli DL 2007: один год эксплуатации

Практически в любых слесарных или электромонтажных работах не обойтись без пассатижей. Этот шарнирно-губцевый инструмент без преувеличения можно назвать многофункциональным. С его помощью можно...

Как быстро отпаривать одежду? Обзор бюджетного отпаривателя для одежды Futula ST1200

В этом коротком обзоре речь будет идти о бюджетном отпаривателе для одежды от компании Futula. На момент публикации это устройство стоит около 800 рублей, и скоро узнаем, на что оно способно....