139 000 нейронов как на ладони: создана первая полная 3D-карта мозга дрозофилы

Пост опубликован в блогах iXBT.com, его автор не имеет отношения к редакции iXBT.com
| Рассуждения | Наука и космос

В научном мире свершилось событие, масштаб которого трудно переоценить: ученые завершили создание полного коннектома мозга взрослой мухи дрозофилы. Это означает, что впервые удалось составить карту всех связей между нейронами, составляющими мозг этого насекомого. На сегодняшний день коннектом дрозофилы является наиболее полным и сложным из всех, когда-либо созданных. Он охватывает 139 тысяч нейронов и миллионы связей между ними, открывая беспрецедентные возможности для изучения принципов работы мозга.

Проект, получивший название FlyWire, стал результатом многолетней работы международной команды исследователей. Для создания коннектома ученым пришлось проанализировать гигантский массив данных, полученных с помощью серийной просвечивающей электронной микроскопии. Мозг мухи был разрезан на тончайшие срезы, каждый из которых был отсканирован с высоким разрешением. Затем эти изображения были объединены в единый трехмерный объем, а нейроны и связи между ними были вручную прослежены и аннотированы.

Карта нейронных связей, вольная интерпретация
Автор: ИИ Copilot Designer//DALL·E 3 Источник: www.bing.com

Создание коннектома — невероятно трудоемкий процесс, требующий не только мощных компьютеров, но и кропотливой работы специалистов. Для ускорения процесса ученые разработали специальную онлайн-платформу, позволившую привлечь к аннотированию нейронов не только профессиональных исследователей, но и энтузиастов со всего мира.

На первый взгляд может показаться странным, зачем ученым понадобилась столь подробная карта мозга мухи. Дрозофила — это, безусловно, не самое сложное существо на планете. Однако, несмотря на кажущуюся простоту, мозг этого насекомого позволяет ему демонстрировать удивительно сложное поведение.

Мухи способны к обучению, запоминанию, пространственной навигации и даже к принятию решений в условиях неопределенности. Все эти способности реализуются благодаря сложной сети нейронных связей, которая, как выяснилось, имеет удивительную степень сходства с мозгом млекопитающих.

a, Все морфологии нейронов реконструированы с помощью программы FlyWire. Все нейроны в центральном мозге и обеих зрительных долях были сегментированы и выверены. Обратите внимание, что изображение и набор данных зеркально перевернуты по отношению к нативному мозгу мухи. b, Обзор многих ресурсов FlyWire, которые становятся доступными. FlyWire использует существующие ресурсы для получения изображений с помощью электронной микроскопии, созданные Zheng et al. 9 (здесь и далее см. оригинальное исследование), предсказания синапсов, созданные Buhmann et al.7 и Heinrich et al.118, и предсказания нейротрансмиттеров, созданные Eckstein et al. 10. Аннотации набора данных мозга FlyWire, такие как гемилинии, нервы и иерархические классы, представлены в сопроводительной статье 12. c, FlyWire использует CAVE 50 для корректуры, управления данными и бэк-энд анализа. Доступ к данным можно получить программно через CAVEclient, navis, fafbseg и natverse119, а также через браузер в Codex, Catmaid Spaces и braincircuits.io. Также доступен статический экспорт данных. d. Мозг дрозофилы можно разделить на пространственно определенные области на основе нейропилей80 (Extended Data Fig. 1). Нейропили для пластинки не показаны. D — дорсальный; L — латеральный; P — задний. e — Синаптические бутоны в мозге мухи часто полиадичны, то есть на один пресинаптический бутон приходится несколько постсинаптических партнеров. Каждая связь между пре- и постсинаптическим местом является синапсом. f, Нейронные тракты, трахеи, нейропиль и тела клеток легко идентифицируются по данным электронной микроскопии, полученным Zheng et al. 9. Масштабная линейка 10 мкм.
Автор: Dorkenwald, S., Matsliah, A., Sterling, A.R. et al. Neuronal wiring diagram of an adult brain. Nature 634, 124-138 (2024). https://doi.org/10.1038/s41586-024-07558-y CC-BY 4.0 Источник: www.nature.com

Изучение коннектома дрозофилы может пролить свет на фундаментальные принципы работы мозга не только у насекомых, но и у более высокоорганизованных животных, включая человека.

Помимо создания самой карты нейронных связей, важнейшим достижением проекта FlyWire стала разработка системы аннотаций, позволяющей упорядочить огромное количество информации, содержащейся в коннектоме. Ученые разработали иерархическую систему классификации нейронов, включающую несколько уровней: от общих категорий, таких как «сенсорные нейроны» и «моторные нейроны», до уникальных идентификаторов для каждого типа нейронов.

Сравнение коннектома FlyWire с коннектомом части мозга мухи, полученным в рамках проекта hemibrain, продемонстрировало удивительную степень стереотипности в организации мозга. Оказалось, что количество нейронов каждого типа, а также связи между ними, практически идентичны у разных особей.

a, Иерархическая схема аннотаций для набора данных FlyWire (см. сопутствующую статью 1 в ориг. исследовании). Аннотации для примера типа клеток DA1 lPN (справа) выделены красным цветом. b, Изображения нейронов для каждого суперкласса. AN — усиковый нерв; APhN — добавочный глоточный нерв; CV — шейный соединительный; d — дорсальный; m — медиальный; MxLbN — верхнечелюстно-лабиальный нерв; NCC — кардиальные нервы; OCG — глазничный ганглий; ON — затылочные нервы; PhN — глоточный нерв; p — задний. c — количество аннотаций в поле. Каждый цвет в столбике обозначает дискретные значения; цифры над столбиками обозначают дискретные значения. d, Количество левых и правых нейронов в суперклассе. Внизу — расположение левой и правой сомы, соответственно. e, Разбивка количества сенсорных нейронов по модальностям. f, Блок-схема связи на уровне суперклассов, feed-forward (afferent to intrinsic to efferent).
Автор: Schlegel, P., Yin, Y., Bates, A.S. et al. Whole-brain annotation and multi-connectome cell typing of Drosophila. Nature 634, 139-152 (2024). https://doi.org/10.1038/s41586-024-07686-5 CC-BY 4.0 Источник: www.nature.com

Это открытие подтверждает гипотезу о том, что мозг дрозофилы развивается по строго детерминированной программе, что делает его идеальным объектом для изучения генетических и молекулярных механизмов формирования нейронных сетей.

Вместе с тем, ученые обнаружили и некоторые вариации в строении мозга мухи. Например, количество нейронов одного типа, участвующих в обработке обонятельной информации, оказалось значительно больше у мух, чей коннектом был получен в рамках проекта FlyWire, по сравнению с мухами из проекта hemibrain.

Более того, оказалось, что мозг мухи способен компенсировать подобные изменения, адаптируя связи между нейронами таким образом, чтобы сохранить функциональность системы.

Наконец, проект FlyWire позволил ученым разработать новые методы для автоматической идентификации типов нейронов, основанные на анализе их связей. Эти методы уже сейчас помогают ученым разбираться в сложных нейронных сетях мозга мухи и, вероятно, в будущем найдут применение и в исследованиях мозга других животных.

Создание полного коннектома мозга дрозофилы — это настоящий прорыв в нейробиологии. Он открывает новые возможности для изучения фундаментальных принципов работы мозга, и, возможно, в будущем поможет нам разгадать тайну сознания.

FlyWire — это только начало. Впереди — создание коннектомов мозга более сложных организмов, что, несомненно, станет еще одним важным шагом на пути к пониманию того, как работает наш собственный мозг.

1 комментарий

Y
Будущее — за его Величеством Искусственным Интеллектом.
А не за мозгом ограниченных белковых существ

Добавить комментарий

Сейчас на главной

Новости

Публикации

Феномен солнечного заживления: как звезда восстанавливается после вспышек?

Солнце, источник жизни на Земле, — это не статичный шар света, а бурлящий океан плазмы, где постоянно происходят мощные процессы. Одним из самых впечатляющих и, одновременно, опасных...

Обзор ЦАПа Akliam PD6: один из лучших нейтрально звучащих ЦАПов

Мобильный ЦАП Akliam PD5 в том году стал чуть ли не лучшим решением в срезе цены и качества. Причем он имел не только шикарный звук, но и высочайшего класса измерения. Однако, прогресс, как вы...

Клей из каменного века? Неандертальцы варили клей 65 000 лет назад в Гибралтарской пещере

Гибралтар — место, где скалы хранят молчаливые свидетельства прошлого. В одной из таких скал, нависающей над Альборанским морем, расположена пещера Вангард, ставшая настоящим порталом в...

Можно ли зарядить аккумулятор автомобиля на холостом ходу и как это правильно сделать?

Многих водителей интересует, возможно ли зарядить аккумулятор автомобиля, оставив двигатель работать на холостых оборотах. Особенно этот вопрос становится актуальным зимой, когда батарея может...

Как телефоны считают наши шаги и можно ли доверять этим данным?

Вы когда-нибудь задумывались, как смартфон, лежащий в вашем кармане, знает, сколько шагов вы прошли? Это не магия и не какие-то древние заклинания — всё намного проще и интереснее....

Взрыв сверхновой может раскрыть тайну темной материи за 10 секунд

Загадка темной материи, незримой субстанции, составляющей 85% массы Вселенной, уже почти столетие будоражит умы ученых. Несмотря на многочисленные попытки, ее природа остается неуловимой, скрытой...