Невидимый фронт микромира: как растения и микробы сражаются за выживание

Пост опубликован в блогах iXBT.com, его автор не имеет отношения к редакции iXBT.com

Природа — это арена постоянного соперничества, где за право на существование борются не только крупные животные, но и невидимые глазу микроорганизмы. В этой борьбе за ресурсы и выживание растения, кажущиеся нам пассивными обитателями планеты, на самом деле являются активными участниками сложнейших взаимодействий с миром микробов. Одной из ярких иллюстраций этой невидимой войны служит неприметное водное растение — ряска, или водяная чечевица.


Ряска поражает своей способностью к быстрому росту, удваивая свою биомассу всего за сутки. Такая скорость размножения обеспечивается не только эффективным фотосинтезом, но и сложным взаимодействием с микроорганизмами, составляющими ее микробиом. Микробиом — это уникальное сообщество бактерий, вирусов, грибов и других микроскопических существ, которые населяют не только поверхность растения, но и его внутренние ткани. Микробиом не просто сосуществует с растением, он активно влияет на его жизнедеятельность, формируя своеобразную экосистему в миниатюре.

Растения против бактерий, иллюстрация
Автор: ИИ Copilot Designer//DALL·E 3 Источник: www.bing.com

В этой микроэкосистеме присутствуют как союзники, так и враги. Одни микробы помогают растению усваивать питательные вещества, защищают его от болезнетворных организмов и стимулируют рост. Другие же — патогены, стремящиеся проникнуть в ткани растения и использовать его ресурсы для собственного размножения. Эта постоянная борьба между полезными и патогенными микроорганизмами оказывает существенное влияние на здоровье и развитие растения.

В ходе эволюции растения выработали сложные механизмы защиты от микробов-агрессоров. Одним из важнейших элементов этой защитной системы являются устьица — микроскопические поры, расположенные на поверхности листьев, стеблей и даже корней. Устьица играют ключевую роль в газообмене и транспирации, обеспечивая поступление углекислого газа и выделение кислорода и водяного пара. Но помимо этой жизненно важной функции, устьица служат своеобразными воротами, которые растение может закрывать, предотвращая проникновение патогенных микроорганизмов в свои ткани.

Штаммы, продуцирующие ИАА и подавляющие длину корней, в изобилии присутствуют в тканях корней дикого типа. 3D-реконструкция по данным конфокальной микроскопии корней арабидопсиса дикого типа после обработки (A) без бактерий, (B) Bacillus RU3D, не продуцирующим ИАА, (C) Microbacterium RU1A, (D) Microbacterium RU33B, продуцирующим ИАА, (E) Herbaspirillum RU5E, продуцирующим ИАА, и (F) Azospirillum baldaniorum Sp245, продуцирующим ИАА. Каналы микроскопии — синий (калькофлюор белый используется для окрашивания клеточной стенки) и зеленый (SYBR Gold DNA используется для окрашивания ядер и бактерий). Белые стрелки указывают местоположение бактерий на основании размера пятен, окрашенных ДНК. Бактерии показаны как зеленые пятна, которые меньше по размеру, чем ядра растений.
Автор: Gilbert, S.; Poulev, A.; Chrisler, W.; Acosta, K.; Orr, G.; Lebeis, S.; Lam, E. Auxin-Producing Bacteria from Duckweeds Have Different Colonization Patterns and Effects on Plant Morphology. Plants 2022, 11, 721. https://doi.org/10.3390/plants11060721 CC-BY 4.0 Источник: www.mdpi.com

Однако микробы — это изобретательные противники, способные находить обходные пути и слабые места в защите растения. Одним из ключевых инструментов в этой невидимой войне являются растительные гормоны, в частности, ауксины. Ауксины — это группа органических веществ, которые регулируют множество процессов в жизни растения, включая рост клеток, формирование корней, цветение и плодоношение. Растение способно точно контролировать уровень ауксинов, что позволяет ему адаптироваться к изменяющимся условиям окружающей среды и защищаться от стрессовых факторов, в том числе и от атак патогенов. Например, при обнаружении инфекции растение может снизить концентрацию ауксинов в пораженных тканях, что приводит к замедлению роста и ограничивает распространение патогена.

Но некоторые бактерии научились вмешиваться в эту сложную систему гормональной регуляции. Они сами способны синтезировать ауксины, подобно растениям, и используют их в качестве инструмента для манипуляции растением-хозяином. Под воздействием бактериальных ауксинов происходят изменения в архитектуре корневой системы растения: главный корень становится короче, а боковые отростки и корневые волоски, наоборот, усиливают свой рост. Такие изменения могут быть выгодны для бактерий, поскольку увеличивают площадь поверхности корня, доступную для колонизации.


Ученые, изучающие взаимодействие растений и микробов, обнаружили, что далеко не все бактерии, способные продуцировать ауксины, оказывают влияние на рост растений. Только те бактерии, которые синтезируют достаточно большое количество гормонов, могут преодолеть защитные барьеры растения и вызвать изменения в его развитии. Это свидетельствует о том, что растения обладают механизмами, позволяющими им «игнорировать» низкие концентрации бактериальных ауксинов.

Продуцирующий ИАА штамм Azospirillum baldaniorum Sp245 колонизирует ткани листа через стомы. Конфокальная микроскопия ортогонального вида (A, B) листьев дикого типа и (C) axr1-3, инокулированных Azospirillum baldaniorum Sp245. Обратите внимание, что на панелях A и B для сравнения представлены оси z внутри стомы и на поверхности клетки, соответственно. Каналы микроскопии — синий (калькофлуор белый), зеленый (SYBR Gold DNA) и красный (автофлуоресценция хлорофилла). Белые стрелки указывают местоположение бактерий на основании размера пятен, окрашенных ДНК. Бактерии показаны как зеленые пятна, которые меньше по размеру, чем ядра растений.
Автор: Gilbert, S.; Poulev, A.; Chrisler, W.; Acosta, K.; Orr, G.; Lebeis, S.; Lam, E. Auxin-Producing Bacteria from Duckweeds Have Different Colonization Patterns and Effects on Plant Morphology. Plants 2022, 11, 721. https://doi.org/10.3390/plants11060721 CC-BY 4.0 Источник: www.mdpi.com

Исследования показали, что бактерии-захватчики, способные манипулировать уровнем ауксинов, используют эти гормоны для того, чтобы «взломать» систему управления устьицами. Они обманывают замыкающие клетки, заставляя их открываться, и тем самым обеспечивают себе доступ в внутренние ткани растения. Такая стратегия позволяет бактериям колонизировать растение и использовать его ресурсы для собственного размножения.

Изучение этих микроскопических баталий имеет огромное значение не только для фундаментальной науки, но и для развития биотехнологий. Понимание механизмов взаимодействия растений и микробов открывает новые возможности для управления ростом и развитием растений, повышения их устойчивости к стрессовым факторам и болезням. Манипулируя составом микробиома и уровнем растительных гормонов, мы можем создавать более продуктивные и устойчивые агроэкосистемы, способные обеспечить продовольственную безопасность планеты в условиях изменения климата.